Muzeum leží na okraji města Ílhavo na nepravidelné parcele lemované dvoupatrovými rodinnými domky. Na protější straně ulice je rozlehlé zdravotní centrum. Provedená přestavba a rozšíření téměř zdvojnásobilo zastavěnou plochu muzea (nyní 3850 m²) a přeorganizovalo půdorysné uspořádání, vedení instalací i celkový obraz stavby. Původní zarovnání fasády s ulicí zůstalo zachováno; nová část přibyla uvnitř parcely, kde vytváří interiérovou zahradu. Různá předepsaná omezení vedla k rozhodnutí položit objekty vedle sebe a zachovat jejich autonomii. Nejzákladnější součástí projektu bylo znovu promyslet konstrukci a funkci prvků stávající stavby, k níž bylo přes celou délku přičleněno úzké křídlo obsahující vstup a technické zázemí. Nově postavené části jsou 'kotveny' do tohoto křídla: pompézní Sala da Ria; centrální věž z černé břidlice tajemně plovoucí na vodní hladině je primárně určená k dočasným výstavám; administrativní část s knihovnou a kavárnou. Vodní prvek je patrný ze všech částí budovy a je klíčovým rysem celého muzea a symbolicky doprovází jeho funkci (námořní muzeum), zároveň slouží jako rezervní zdroj pro požárníky a nabízí se jako potenciální prostor k výstavám.